Читать статья по медицине, физкультуре, здравоохранению: "Экономика и эффективность при визуализации и моделирование программированной клеточной гибели при ишемической болезни сердца в эксперименте" Страница 1

(Назад) (Cкачать работу)

Экономика и эффективность при визуализации и моделирование программированной клеточной гибели при ишемической болезни сердца в эксперименте Касым Р.Т. - магистр, член Ассоциации ВТПУ, старший преподаватель

Тленшиев Н.А. - магистрант

Визуализация биологических данных является частью биоинформатики, которая фокусируется на вопросах применения компьютерной графики в различных областях наук о жизни. Только часть проблем, которые решаются в этой области включают визуализацию генома, макромолекулярных структур, филогению зубов, микроскопию и визуализацю данных магнитно-резонансной томографии. Программное обеспечение систем визуализации также разнообразно, начиная от сравнительно простых до сложных интегрированных программных решений. Визуализация широко используется в образовательных целях. В свою очередь различные методы моделирования используются для раскрытия сущности процессов, законов функционирования и описания систем. Моделирование биологических систем является одной из наиболее важных задач системной биологии и биоинформатики. Вычислительная биология развивает алгоритмы, структуры данных и методы визуализации и моделирования биологических систем. Методы компьютерного моделирования и соответствующие языки моделирования на основе XML часто используются при решении задач. Одной из задач является проблема моделирования и визуализации процесса апоптоза. Апоптоз играет важную роль во многих физиологических состояниях и заболеваниях [1], например в понимании развития рака и сердечно-сосудистых заболеваний. Общепринятыми стандартами моделирования (не только апоптоза) являются SBML [2], BioPax и CellML [3]. Есть также сравнительно новые проекты, включающие в себя FieldML [4, 5] - язык, который описывает пространства (поля) и используется для описания органов человеческого тела. Несмотря на существующий прогресс, задача визуализации биохимических процессов и моделей не решена полностью. Поэтому мы предлагаем подходы к визуализации моделей апоптоза на базе качественных(описательных) и количественных моделей. Для реализации некоторых видов визуализации, разработаны видео ролики и программное обеспечение на основе игрового движка и C#. Для поддержки процесса, была создана база данных трехмерных моделей молекулярных комплексов.

В отчете приводится краткий и, по-видимому неполный, обзор языков и сред моделирования биологических процессов, которые используются и могут быть использованы для описания апоптоза. Также дается анализ подходов создания системы визуализации моделей апоптоза.

Описывается область исследований, включающая задачу визуализации биологических моделей на разных уровнях иерархии

Описывается создание анимации и статических визуализаций процесса апоптоза с использованием качественных (описательных) моделей

Рассматривается визуализация апоптоза и моделей, основанных на языке CellML

Приводится описание рабочего прототипа программы симуляции молекулярных процессов, описываемых моделями на языке CellML.

Целью исследования являлось моделирование процессов апоптоза.

Задачей работы было моделирование процессов апоптоза для научно-образовательных программ с созданием сайта.

Порядка 60 миллиардов клеток в теле человека погибают

Похожие работы